as funcionalidades do SI-PNI são limitadas à realização do cálculo acerca da cobertura vacinal por estados e municípios.

o SI-PNI impede que seja feita uma avaliação dinâmica do risco quanto à ocorrência de surtos ou epidemias, a partir do quantitativo populacional vacinado.

o SI-PNI não permite o acompanhamento de casos de reação adversa ocorridos pós-vacinação, tampouco a identificação e localização de lotes de vacinas.

as funcionalidades do SI-PNI são limitadas à consolidação do quantitativo populacional vacinado, organizado por faixa etária e em determinada área geográfica.

o SI-PNI possibilita o controle do estoque de imunobiológicos, gerando informações necessárias para que sejam programados os processos de aquisição e distribuição.