A morfologia bacteriana é imprescindível para o diagnóstico dos microrganismos. A sua pesquisa ocorre através da microscopia e da coloração de gram, com a observação de forma, arranjo e coloração assumida pelas bactérias. De acordo com o arranjo dos cocos e a coloração positiva e negativa pelo gram, Streptococcus pneumoniae, Neisseria menigitidis e Staphylococcus epidermidis possuem, respectivamente, arranjo e coloração: