no município de São Luís, localizado a sudoeste do centro urbano, entre a margem direita do Rio Bacanga e a região do Maracanã. Preserva o pedaço Floresta Amazônica protetora de mananciais, cujas nascentes naturais alimentam a represa do Batatã. Caracteriza-se por um relevo plano e ambiente costeiro, influenciado pela dinâmica das marés, favorecendo o estabelecimento de ecossistemas como os manguezais.

nos municípios de Barreirinhas e Primeira Cruz, caracteriza- se por apresentar uma vegetação tipicamente de transição, cerrado-restinga. Com predominância de um clima quente semi-úmido, a região apresenta anualmente duas estações distintas, uma seca e outra chuvosa. Seu solo é arenoso, formando dunas que se prolongam desde o Golfão Maranhense até a foz do Rio Parnaíba.

entre as nascentes dos rios Alpecartas e Itapecuru, região centro-meridional do Maranhão. Destacam-se na sua vegetação as árvores de pequeno porte, retorcidas e de casca grossa, entre elas as mais importantes: o pau-terra, o pequi, a lobeira e, ainda, o bacuri e o murici (frutíferas), sucupira e jabota (medicinais). A mata ciliar é constituída principalmente por palmeiras de buriti. Entre as espécies da fauna, algumas espécies de animais ameaçados de extinção como o urubu-rei, o tatu-canastra e o cachorro-do-mato-vinagre.

nos municípios de Carutapera e Bom Jardim. Este parque veio a constituir a primeira unidade de conservação estabelecida na região chamada préamazônica maranhense, com denominação de floresta úmida Perenófila.

localiza-se no Litoral Ocidental do Estado, a 45 km da costa maranhense, sendo que o local mais próximo, em terra firme, é a Ilha de Maiau. Com relação a São Luís, o Parque dista cerca de 100 km, ao norte da Baía de São Marcos, tendo como ponto mais próximo (50 km), a Ilha dos Lençóis.