A anatomia coronariana é ponto muito importante na análise anatômica da TGA, pois a reimplantação dos óstios coronarianos na operação de Jatene é um aspecto bastante valorizado quando se estudam os resultados tardios desse procedimento.

A via de saída do VE deve ser estudada, pois a obstrução subpulmonar fixa, ao contrário da estenose subpulmonar dinâmica ou hipertrófica, pode ser quase sempre identificada.

A circulação sistêmica é representada pelo fluxo de sangue que sai do VD para a aorta, o leito vascular sistêmico, as veias cavas, o átrio direito e novamente o VD.

Quando a resistência pulmonar é baixa, o fluxo sistólico é da direita para a esquerda para a circulação de baixa resistência, e o fluxo diastólico é preferencialmente direcionado da esquerda para a direita, pois o VE tem sobrecarga de volume.

Os casos de pior evolução clínica são aqueles em que a TGA apresenta CIA restritiva, septo interventricular íntegro e ausência de PCA.