Esse sistema tem como desvantagem a alta exigência de mão de obra.

A impossibilidade de controlar a direção e o baixo potencial de uniformidade de aplicação de água é uma desvantagem desse sistema.

Na prática, a intensidade de aplicação de água na extremidade da linha de irrigação varia muito, tornando-se necessárias práticas de conservação de solo para reduzir ou mesmo evitar o escoamento superficial.

Para a implantação do pivô central, não é obrigatório que a área esteja totalmente livre de obstáculos ou qualquer elemento que limite a movimentação da linha de irrigação.

Nesse sistema não há possibilidade de aplicação de fertilizantes e outros produtos químicos.