Em crianças aparentemente normais ao nascimento, mas com salivação excessiva, a permeabilidade do esôfago através da passagem da sonda nasogástrica deve ser observada.

O sintoma sugestivo da fístula traqueoesofágica também é a severa cianose que se segue à tentativa de alimentação.

O insucesso na passagem da sonda nasogástrica associado à radiografia simples de abdome, com presença de ar no delgado, é indicativo de atresia com fístula distal.

A obliteração do coto proximal com fístula traqueoesofágica distal corresponde a 90% das atresias do esôfago.

A radiografia contrastada do esôfago com bário deve ser solicitada para a comprovação diagnóstica.