O sulco gengival abriga uma flora miocrobiana, tanto nos estados de saúde quanto na doença, nos sulcos de adultos jovens saudáveis; a flora é relativamente simples e esparsa, sendo quase dois terços compostos por cocos Gram-negativos.

A resposta imunológica tem características tanto protetoras quanto destrutivas; nas doenças associadas às bactérias da placa, ela pode contribuir para o processo da doença ou modular os efeitos bacterianos.

A despolimerização do colágeno observada na doença periodontal, apesar de ser resultante principalmente da liberação de colagenase de origem bacteriana, também pode resultar de colagenase individual.

Os efeitos diretos das bactérias sobre os tecidos periodontais são antagônicos aos efeitos indiretos de interferência na resposta de hospedeiro, na gênese da doença periodontal.