Considere a existência de quatro amostras (A, B, C e
D) provenientes de sequenciamento do genoma de
Candida albicans. Foi utilizada a plataforma Illumina
e a biblioteca foi preparada visando alta
complexidade. As corridas foram avaliadas após
controle de qualidade. A tabela a seguir apresenta os
principais parâmetros obtidos:
Com relação ao controle de qualidade, as possíveis interpretações para essas amostras são:
I. Amostra aceitável, mas recomenda-se trimming adicional para remoção de adaptadores. II. Amostra de baixa qualidade geral, com elevada duplicação e forte contaminação por adaptadores. III. Amostra com excelente qualidade geral, adequada para análise downstream sem necessidade de retrimming. IV. Amostra com possível viés de composição e indícios de problema na construção da biblioteca.
Assinale a alternativa que apresenta a associação CORRETA entre as amostras e as interpretações:
| Amostra | Q30 (%) | Conteúdo GC (%) | Sequencias duplicadas (%) | Adaptadores detectados |
|---|---|---|---|---|
| A | 71 | 65 | 42 | Presença significativa |
| B | 94 | 51 | 8 | Não |
| C | 60 | 38 | 55 | Alta presença |
| D | 88 | 52 | 15 | Leve presença |
Com relação ao controle de qualidade, as possíveis interpretações para essas amostras são:
I. Amostra aceitável, mas recomenda-se trimming adicional para remoção de adaptadores. II. Amostra de baixa qualidade geral, com elevada duplicação e forte contaminação por adaptadores. III. Amostra com excelente qualidade geral, adequada para análise downstream sem necessidade de retrimming. IV. Amostra com possível viés de composição e indícios de problema na construção da biblioteca.
Assinale a alternativa que apresenta a associação CORRETA entre as amostras e as interpretações:
