O micrótomo é um instrumento usado para a obtenção de cortes sucessivos, delgados e uniformes, a partir dos blocos preparados com as peças incluídas.

Com o micrótomo, é possível processarem-se cortes histológicos de 0,1 a 7 μm de espessura.

Os procedimentos para a microtomia devem ser executados sob condições de máxima assepsia.

O micrótomo é um aparelho formado por uma lâmina (fixa ou descartável) de aço, afiada, e um braço ao qual se prende o bloco e que se desloca verticalmente.