A classificação de bactérias anaeróbias baseia-se em reações químicas da cadeia respiratória desses microrganismos que geralmente se utilizam de gás oxigênio.

Bactérias anaeróbias estritas são capazes de produzir toxinas que podem ser letais para as células acometidas.

Bactérias anaeróbias estritas podem desenvolver-se na presença de oxigênio, desde que outras substâncias atuem em conjunto com este gás.

Anaeróbios oxigenotolerantes, também denominados aerotolerantes são capazes de se adaptarem em grandes concentrações de oxigênio.

Para crescimento de bactérias anaeróbias microaerófilas, é necessária baixíssima concentração de gás carbônico.