O hidróxido de cálcio P.A. apresenta elevado pH, entre 11 e 12, considerado um aspecto negativo desse material.

O hidróxido de cálcio P.A. apresenta baixa resistência mecânica, o que dificulta a aplicação direta de materiais restauradores condensáveis.

O hidróxido de cálcio P.A. pode produzir calcificações ectópicas ou barreira mineralizada irregular e incompleta, característica inerente ao material e que se mantém independente do operador.

Em comparação com o hidróxido de cálcio P.A., o cimento de hidróxido de cálcio promove uma camada mais densa de necrose por coagulação, por isso a importância de colocação do hidróxido de cálcio P.A. em casos de exposição pulpar.

Os cimentos de hidróxido de cálcio apresentam pH mais alcalino em relação ao hidróxido de cálcio P.A., o que é considerado uma vantagem desse material.