A construção de mapas genéticos e a detecção de QTL (quantitative trait loci) para a determinação de características economicamente importantes têm sido geradas no gênero Eucalyptus, principalmente com marcadores dominantes como RAPD e RFLP. Entretanto, esses marcadores possuem limitada capacidade de gerar informações, que são quase todas sem utilidade para os estudos de mapeamento comparativo e validação de QTL em mapas não relacionados e pedigrees.