Um dos mecanismos pelo qual a H. pylori pode provocar anemia é Interferência na produção de hepcidina, hormônio produzido no fígado que regula o metabolismo do ferro nos enterócitos e a sua liberação dos macrófagos do sistema retículo endotelial.

A H. pylori pode ser possível fator de risco para doença de Parkinson; a erradicação da bactéria melhora os sintomas motores, mas não cura a doença. A erradicação da bactéria resulta também em melhor absorção de L-Dopa, favorecendo melhor controle da doença.

A anemia perniciosa é o estágio final decorrente da infecção pelo H. pylori.

O Estágio II da deficiência de vitamina B corresponde ao aumento dos níveis de homocisteína e ácido metilmalônico, com diminuição da síntese de DNA e surgimento de sintomas neuropsiquiátricos.