A presença de sinais de alarme, como anemia ferropriva, perda de peso não intencional e disfagia persistente, constitui uma indicação absoluta para a realização de endoscopia digestiva alta.

A endoscopia digestiva alta é indicada rotineiramente para o acompanhamento de todos os casos de gastrite crônica leve sem atrofia ou metaplasia intestinal confirmada por biópsias prévias.

A ocorrência de infarto agudo do miocárdio nas últimas duas semanas é considerada uma contraindicação absoluta para qualquer procedimento endoscópico, mesmo em casos de hemorragia digestiva grave.

O rastreamento de esôfago de Barrett deve ser realizado anualmente em todos os pacientes com sintomas eventuais de pirose, independentemente da duração dos sintomas ou de fatores de risco associados.

A suspeita de perfuração de víscera oca com pneumoperitônio visualizado em radiografia de abdome é uma indicação clássica para a realização de colonoscopia diagnóstica de emergência.