As causas da depleção dos estoques pesqueiros de espécies migradoras, geralmente de nível trófico elevado, nos ecossistemas fluviais e lacustres, estão mais relacionadas às pressões exercidas pela pesca do que pelas alterações impostas nos ecossistemas pelos represamentos.

As medidas simples que envolvem a estocagem de peixes, a introdução de espécies ou mesmo o controle da atividade mostram-se pouco eficientes devido à complexidade dos ecossistemas aquáticos continentais.

O represamento dos rios atinge, em maior proporção, as espécies dos níveis tróficos inferiores, o que acarreta mudanças em toda estrutura da comunidade.

Medidas regulatórias que estipulem um valor máximo de captura de espécies pertencentes aos níveis tróficos superiores são eficientes para o retorno e recuperação dos estoques naturais.

A transposição de espécies migradoras em barragens resultou na ocupação e recuperação das mesmas à montante e jusante dos empreendimentos.