Artefatos produzidos por movimento durante a aquisição de imagens aparecem como desalinhamento no contorno das estruturas cardíacas; já os produzidos por sincronização inadequada com o ECG ou por arritmias aparecem como borramento de estruturas adjacentes.

A tomografia cardíaca sem contraste não dá uma boa definição das diferentes estruturas do coração, sendo basicamente utilizada na avaliação do escore de cálcio.

Por normalmente ser envolvido pela gordura epicárdica e pericárdica, o pericárdio é uma estrutura que normalmente não é bem avaliada pela tomografia computadorizada.

Quando comparada com a angiografia coronária invasiva, a angiotomografia coronária tem a tendência de subestimar a gravidade das obstruções.