O controle esofágico da deglutição depende de aferências trigeminais bilaterais sincronizadas com impulsos do fascículo longitudinal medial.

A fase faríngea da deglutição é desencadeada por impulsos exclusivamente simpáticos, mediados por núcleos medulares da via tectoespinhal.

A fase oral propulsiva está sob regulação do núcleo motor do trigêmeo, cuja ação ocorre de modo contínuo e automático, independente de aferência cortical voluntária.

O padrão central gerador de deglutição está localizado no tronco encefálico e envolve circuitos polissinápticos mediados pelo núcleo do trato solitário e o núcleo ambíguo.

O reflexo de deglutição depende exclusivamente de circuitos extrapiramidais mediados por núcleos do cerebelo e da substância negra compacta.