A adoção do ICMS-E é dificultada pelo fato de esse instrumento não possibilitar o tratamento dos recursos naturais como ativos financeiros pelo sistema tributário estadual.

Em todos os estados que instituíram o ICMS-E, as receitas repassadas aos municípios estão vinculadas a despesas com programas de preservação ambiental.

A aplicação dos recursos financeiros repassados pode ser realizada integralmente em projetos não relacionados à conservação ambiental.

Como os danos ambientais são de difícil reparação, ou mesmo irreparáveis, a instituição do ICMS-E privilegia o Princípio Ambiental da Prevenção, o que representa a superação do modelo clássico de gestão ambiental fundamentado em ações de comando e controle para previsão e prevenção dos danos ambientais.