Se o diagnóstico da isquemia mesentérica aguda for feito por angiografia, a infusão do vasodilatador papaverina por meio do cateter de angiografia pode melhorar a sobrevida tanto na isquemia oclusiva, mas não possui efeitos benéficos na não oclusiva.

O intestino delgado é irrigado exclusivamente pela artéria mesentérica superior, a qual é ramo direto da aorta e irriga também parte do intestino grosso até a flexura esplênica do cólon.

Se o diagnóstico for feito durante laparotomia exploradora, as opções de tratamento são embolectomia cirúrgica, revascularização ou ressecção. Uma segunda análise da laparotomia pode ser necessária para reavaliar a viabilidade de áreas questionáveis do intestino.

Se o diagnóstico e o tratamento da isquemia forem feitos antes de a necrose ocorrer, a mortalidade é baixa; após o infarto intestinal, a mortalidade é cerca de 70 a 90%. Por este motivo, os exames diagnósticos de isquemia mesentérica devem preceder o diagnóstico clínico.