Na última década, observou-se que o uso de terapia antirretroviral combinada altamente eficaz levou a um aumento na incidência de infecções oportunistas em crianças com infecção por HIV adquirida verticalmente.

A pneumonia por Pseudomonas aeruginosa é responsável por aproximadamente dois terços de todas as condições definidoras de AIDS diagnosticadas durante o primeiro ano de vida.

A infecção pelo HIV por si só, as infecções oportunistas e a diminuição das demandas metabólicas podem levar à perda de peso e de massa corporal magra, o que é conhecido como emaciação.

À medida que a infecção pelo HIV persiste sem tratamento eficaz, as crianças sofrem imunossupressão progressiva e desenvolvem a síndrome da imunodeficiência adquirida (AIDS).

Os fatores de risco para o desenvolvimento da encefalopatia pelo HIV incluem: baixa carga viral, contagem alta de CD4, e acesso à terapia antirretroviral.