Nível de mortalidade comparável com o transplante alogênico, mesmo com a baixa complexidade do transplante e o fato do enxerto conter células do próprio paciente.

Ausência de GVHD ou rejeição por serem células enxertadas do próprio paciente, mas pode apresentar rejeição e a doença do enxerto contra o hospedeiro.

Probabilidade de cura é muito pequena principalmente em pacientes com neoplasias hematológicas, pois pode haver uma contaminação durante a coleta de células neoplásicas.

Imunossupressores são utilizados com frequência