As águas subterrâneas classe 3 são de aquíferos, conjunto de aquíferos ou porção desses, com alteração de sua qualidade por atividades antrópicas, e que somente possam ser utilizadas, sem tratamento, para o uso preponderante menos restritivo.

É facultativa, nos laudos analíticos de resultados das análises das águas subterrâneas, a inclusão dos ensaios de adição e recuperação dos analitos na matriz (spike).

Para os aquíferos, conjuntos de aquíferos ou porção desses onde ocorrerem injeção ou recarga, não há necessidade de implantação de um programa específico de monitoramento da qualidade da água subterrânea.

No que se refere às águas subterrâneas classes 3 e 4, qualquer aumento de concentração de contaminantes deverá ser monitorado, permaneça inferior aos valores máximos permitidos.

A proposta de enquadramento das águas subterrâneas em classes deve considerar, no mínimo, os sólidos totais dissolvidos, nitrato e coliformes termotolerantes.