Detecta alterações cromossômicas estruturais, funcionando como método substitutivo à citogenética clássica.

Avalia a morfologia nuclear, permitindo identificar aneuploidias sem necessidade de marcadores fluorescentes.

Mensura diretamente a atividade metabólica mitocondrial, fornecendo informações restritas ao metabolismo energético da célula.

Avalia a expressão gênica, sendo utilizada apenas como técnica de biologia molecular.

Permite analisar simultaneamente características físicas (tamanho e granulosidade) e expressão de antígenos de superfície e intracelulares das células.