O tratamento deve ser iniciado apenas após confirmação por PCR do líquor, uma vez que o antiviral apresenta elevada toxicidade.

O tratamento antiviral oral é suficiente na fase aguda da encefalite.

O tratamento baseia-se em corticosteroides e anticonvulsivantes, não havendo benefício comprovado do uso de antivirais.

O aciclovir está indicado apenas em pacientes imunossuprimidos, sendo dispensável em adultos imunocompetentes.

O tratamento de escolha é aciclovir intravenoso em altas doses, que deve ser iniciado precocemente, mesmo antes da confirmação etiológica.