Patógenos (coliformes) são exclusivos de efluentes hospitalares, ao passo que esgotos domésticos contêm apenas sólidos e matéria orgânica, sem risco microbiológico relevante, conforme a Resolução CONAMA n.º 357/2005.

A poluição difusa, decorrente do escoamento superficial urbano ou agrícola, é intermitente e de difícil controle, e carreia nutrientes (nitrogênio e fósforo).

Esgotos lançados por tubulações são classificados como poluição difusa, pois a rápida diluição da carga orgânica (DBO) impede a identificação do ponto de lançamento.

Metais pesados e agrotóxicos constituem poluição orgânica biodegradável, sendo removidos por tratamento biológico convencional, sem toxicidade aos microrganismos.

A poluição térmica beneficia a autodepuração, pois o aumento da temperatura eleva a solubilidade e a disponibilidade de oxigênio dissolvido para a biota.