A Proteção Social Especial estrutura-se em dois níveis de complexidade — média e alta —, direcionados ao atendimento de pessoas e famílias com direitos já violados.

A Proteção Social Especial tem como finalidade exclusiva a oferta do Serviço de Proteção e Atendimento Integral à Família (PAIF).

No âmbito da Proteção Social Especial de Média Complexidade, são ofertados, de forma exclusiva, os serviços de acolhimento institucional, abrigo e residência inclusiva, destinados a pessoas em situação de rua e com deficiência.

A Proteção Social Especial de Alta Complexidade atua prioritariamente na abordagem das pessoas em situação de rua.

No âmbito da Proteção Social Especial de Alta Complexidade, é ofertado o Serviço de Proteção Social a Adolescentes em Cumprimento de Medida Socioeducativa de Liberdade Assistida (LA) e de Prestação de Serviços à Comunidade (PSC).