O critério de decisão em uma ACB considera um projeto como economicamente vantajoso quando a relação custo-efetividade incremental (RCEI) é inferior a três vezes o Produto Interno Bruto (PIB) per capita.

A análise custo-benefício não permite comparação entre intervenções com desfechos diferentes, pois cada desfecho exige uma unidade de medida específica e incompatível.

Na ACB, tanto os custos quanto os benefícios são expressos em unidades naturais, como anos de vida ganhos ou eventos adversos evitados.

A medida de desfecho da ACB é a razão de custo-benefício, sendo considerado economicamente atrativo apenas quando o valor é inferior a 1.

O valor presente líquido (VPL) e a taxa interna de retorno (TIR) são indicadores utilizados na ACB, considerando-se a monetização de todos os benefícios à saúde.