Os fluorocromos utilizados na microscopia de fluorescência são moléculas capazes de absorver luz em um comprimento de onda específico e emitir luz em um comprimento de onda maior. A luz emitida é captada pelo sistema óptico do microscópio e convertida em uma imagem, permitindo a visualização das estruturas marcadas. Esses fluorocromos ligam-se seletivamente a componentes celulares específicos, como organelas, proteínas ou outras biomoléculas, possibilitando a análise detalhada de sua localização e distribuição na célula.

A tabela a seguir mostra alguns fluorocromos usados em biologia celular.  

Células do sangue humano foram coradas com uma mistura formada pelos quatro fluorocromos. Foram observadas células emitindo luz correspondente aos quatro picos de emissão apresentados na tabela e outras emitindo luz apenas a 558nm.

Considerando as estruturas celulares marcadas pelos fluorocromos, essas células poderiam ser, respectivamente,