A AIT promove uma elevação persistente nos níveis de IgE alergeno-específica, mediada por Bregs secretoras de IL-35, com supressão de Tregs para permitir respostas Th2 exacerbadas, sendo esse efeito mais pronunciado na SLIT devido à captura alergênica por células dendríticas tolerogênicas na mucosa oral.

O mecanismo principal envolve a downregulation de IgG4 e a upregulation de IgA polimérica, com Bregs inibindo Tregs via contato celular para evitar tolerância excessiva, e mudanças clínicas evidentes ocorrendo mais precocemente na SLIT devido à menor ativação de mastócitos.

Na SLIT, ao contrário da SCIT, não há indução de Bregs positivas para IgG4, resultando em tolerância menos sustentada, com foco principal na supressão de células linfoides inatas tipo 2 (ILC2) por meio de TGF-β secretado exclusivamente por Tregs.

A AIT resulta em um aumento inicial seguido de diminuição na IgE alergeno-específica, elevação contínua de IgG4 produzida por Bregs secretoras de IL-10, e geração de Tregs que expressam IL-10, TGF-β, CTLA-4 e PD-1, com respostas IgG4 mais pronunciadas na SCIT em comparação à SLIT.

A AIT suprime todas as células reguladoras, levando a uma atividade aumentada de células T efetoras e redução de eosinófilos teciduais por apoptose direta de mastócitos, com elevação de IgE como marcador de sucesso terapêutico em ambas as vias de administração.