O Marco Lógico constitui instrumento mais voltado ao controle financeiro do projeto, não abrangendo análise de riscos ou verificação de resultados.

No ciclo de projetos, a etapa de monitoramento ocorre após o encerramento da execução, razão pela qual não interfere na tomada de decisões durante a implementação.

A metodologia do Marco Lógico pressupõe encadeamento lógico entre insumos, atividades, produtos, objetivos e impactos, e o estabelecimento de indicadores verificáveis e fatores externos que podem influenciar o sucesso do projeto.

Em projetos públicos baseados no Marco Lógico, a fase de planejamento possui relevância secundária, pois a execução e o aprendizado práticos prevalecem sobre a definição prévia de objetivos e de critérios de avaliação.

O gerenciamento de projetos no setor público depende da análise de stakeholders e de variáveis externas porque a legitimidade administrativa decorre da previsão legal da política pública correspondente.