A conjuntivite gonocócica apresenta-se tipicamente após o terceiro dia de vida, caracterizando-se por secreção aquosa e leve hiperemia conjuntival.

A conjuntivite por inclusão de Chlamydia trachomatis geralmente manifesta-se entre o 5º e o 14º dia de vida, com secreção mucopurulenta e presença de pseudomembranas.

A conjuntivite química, resultante da instilação de nitrato de prata, manifesta-se predominantemente após 2 semanas de vida com intensa secreção purulenta.

Conjuntivites virais neonatais, como aquelas causadas pelo vírus herpes simplex, apresentam-se com vesículas palpebrais e queratoconjuntivite, usualmente dentro das primeiras 24 horas de vida.

Conjuntivites bacterianas não específicas são caracterizadas por início súbito de hiperemia intensa e secreção purulenta dentro das primeiras 48 horas após o nascimento.