São objetivos do SUS a identificação e divulgação dos fatores condicionantes e determinantes da saúde e a assistência às pessoas por intermédio de ações de promoção, proteção e recuperação da saúde.

Dentre as diretrizes do SUS está a integralidade de assistência, caracterizada como um conjunto de ações que visa tratar desigualmente o desigual, atentar para as necessidades coletivas e individuais, procurando investir onde a iniquidade é maior.

A universalidade do SUS garante que todos não precisam ser tratados de forma igual, mas sim ter seus direitos respeitados de acordo com suas diferenças.

A equidade no SUS é o princípio que contempla o conjunto de ações de promoção da saúde, prevenção de riscos e agravos, assistência e recuperação de forma a oferecer um cuidado à saúde integral.

A participação popular e a centralização da gestão na esfera federal são princípios organizacionais do SUS.