A remoção da smear layer (lama dentinária) tem importância restrita à fase de obturação, sendo sua influência no controle microbiológico minimizada quando se utilizam técnicas modernas de obturação termoplastificada.

O hipoclorito de sódio é o irrigante de escolha por sua ação antimicrobiana e capacidade de dissolução de tecido orgânico, porém sua eficácia depende da conformação do canal e da renovação constante da solução.

A clorexidina pode substituir integralmente o hipoclorito de sódio em canais necrosados, desde que associada ao uso de EDTA ao final do preparo.

O EDTA apresenta ação antimicrobiana equivalente ao hipoclorito de sódio quando utilizado de forma contínua durante o preparo químico-mecânico.

O uso de soluções irrigadoras em maior concentração elimina a necessidade de ativação da irrigação para alcançar áreas não instrumentadas do sistema de canais.