O CREF12/PE é organizado e dirigido pelos próprios Profissionais, com independência e autonomia, sem qualquer vínculo funcional, técnico administrativo ou hierárquico com qualquer órgão da Administração Pública.

O Plenário do CREF12/PE poderá indicar anualmente Profissionais Delegados dentre os registrados quites com todas as obrigações legais, com objetivo de ampliar a representatividade do Conselho, acompanhando e difundindo localmente todas as matérias de interesse da categoria.

O Conselheiro sorteado ou designado para a função de Relator de processo administrativo no âmbito do Plenário poderá se declarar impedido para o exercício da função no prazo de 5 (cinco) dias úteis.

O Conselho é dirigido pelo Presidente e Vice-Presidente, com auxílio de uma Diretoria Ampliada, que poderá criar assessorias e nomear seus titulares, com atribuições específicas ao seu funcionamento.

Entre as Câmaras Permanentes do CREF12/PE está a Câmara de Fiscalização, que é competente para a instauração do Procedimento de Sindicância – PS por meio de parecer escrito e motivado e observado o disposto no Código de Ética Profissional.