Após seu endurecimento, o material se contrai; esta contração é responsável pelo grande risco de infiltração marginal das cavidades.

Estudos têm demonstrado bons resultados do MTA como material selador em perfurações radiculares e de furca e como material de apicificação, mas não como material retro-obturador em cirurgias perirradiculares ou como tampão apical.

É pouco solúvel e a massa obtida não se dilui quando está na presença de líquidos teciduais, sendo esta uma vantagem sobre as pastas e os cimentos à base de hidróxido de cálcio.

Uma desvantagem do MTA é que, mesmo quando tem óxido de bismuto em sua composição, apresenta alta radioluscência, o que prejudica sua identificação em imagens radiográficas.

É indicado para irrigação final de canais quando seu pó é misturado a 3 partes de ácido cítrico e uma parte de detergente Tween 80.