o microscópio confocal utiliza luz polarizada que atravessa diferentes planos da amostra, permitindo detectar diferenças de birrefringência entre suas camadas.

a técnica da microscopia confocal permite a eliminação da luz difratada ou refletida pela amostra por meio de filtros posicionados antes e depois da objetiva.

um feixe de laser faz uma varredura ponto a ponto da amostra, e uma pequena abertura bloqueia a luz fora do plano focal, permitindo registrar uma série de cortes ópticos sucessivos.

o equipamento amplifica a diferença de fase entre diferentes feixes de luz para realçar bordas e detalhes internos das células vivas ou amostras fixadas, permitindo o registro em alta definição.

a microscopia confocal depende da autofluorescência da amostra ou de fluoróforos associados a anticorpos que possibilitam observar as estruturas com profundidade sob luz UV.