O "Ç" é classificado como um dígrafo, pois a junção da letra "C" com o sinal da cedilha resulta em um único fonema sibilante que não poderia ser representado de outra forma no sistema.

A ausência do "Ç" no alfabeto justifica-se por ele ser um caractere dotado de sinal diacrítico. Assim como as vogais acentuadas e o til, a cedilha é um sinal acessório que altera o valor fonético da letra base ("C") sem constituir uma nova unidade alfabética.

Segundo o Acordo Ortográfico de 1990, a cedilha é um sinal de pontuação interna que serve para marcar a etimologia de palavras derivadas do latim, sendo facultativa em termos de origem árabe ou tupi.

O "Ç" não integra o alfabeto por ser uma variante alofônica da letra "S", podendo ser utilizado em início de palavras sempre que a vogal subsequente for "a", "o" ou "u" (ex: Çafra, Çuco), visando manter a coerência fonética.