Trata-se do exame padrão-ouro para o diagnóstico definitivo da tuberculose em razão da sua elevada especificidade.

A pesquisa positiva para micro-organismo álcool-ácido resistente pela coloração de Ziehl-Neelsen confirma o diagnóstico da tuberculose.

Nocardia e o Rhodococcus são também micro-organismos álcool-ácido resistentes.

Para a pesquisa de BAAR ser positiva no escarro são necessários mais de 1.000.000 de bacilos por mL, caso contrário a pesquisa pode ser negativa.

O método de coloração de Ziehl-Neelsen não deve mais ser utilizada para a pesquisa de BAAR. Trata-se de um método obsoleto e deve ser substituído pela coloração de Leishman.