Na candidose pseudomembranosa, a utilização de aciclovir pode contribuir para a redução da sintomatologia clínica por interferir na síntese de ácidos nucleicos de microrganismos eucarióticos oportunistas presentes na mucosa oral.

Em infecções odontogênicas agudas com disseminação para tecidos moles, a amoxicilina age por meio da inibição da síntese do peptidoglicano da parede celular bacteriana.

Nas infecções recorrentes pelo vírus herpes simples, o valaciclovir apresenta eficácia clínica relacionada à sua conversão em aciclovir, cuja seletividade farmacológica decorre da ativação preferencial em células infectadas, reduzindo a replicação viral por inibição da transcriptase reversa após sua fosforilação intracelular.

Na queilite angular associada à infecção por Candida spp., o emprego de antifúngicos tópicos fundamenta-se predominantemente na sua capacidade de inibir a síntese proteica ribossomal, reduzindo a adesão do fungo ao epitélio oral.