A gestão da farmácia hospitalar pode ser organizada como setor de apoio às unidades assistenciais, com autonomia operacional limitada e sem necessidade de constar formalmente no organograma institucional.

A assistência farmacêutica integral pode ser substituída por sistemas informatizados de dispensação.

Missão institucional, indicadores e participação em comissões são ações recomendadas, mas não integram os requisitos mínimos de gestão.

A farmácia deve integrar o organograma institucional, sob direção técnica do farmacêutico, com planejamento, indicadores e estrutura compatível com a complexidade do serviço.

Os parâmetros mínimos da Sociedade Brasileira de Farmácia Hospitalar estabelecem exigências predominantemente estruturais e funcionais, ficando a adoção de instrumentos formais de planejamento e avaliação de desempenho condicionada às prioridades da instituição.