O reconhecimento de área livre de pragas é outorgado pela Secretaria de Defesa Agropecuária do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA) e ocorre ao final do período mínimo de um ano de monitoramento pelo órgão de defesa agropecuária estadual.

A região compreendida entre os municípios de Aracati, Icapuí, Itaiçaba, Jaguaruana, Limoeiro do Norte, Russas e Quixeré é reconhecida como produtora de cucurbitáceas livres da mosca-das-cucurbitáceas (Anastrepha grandis). Por considerar o risco de introdução dessa praga nesses municípios e o potencial econômico da região, o governo estadual proibiu a entrada, nessa região, de cucurbitáceas produzidas fora desses municípios e tornou obrigatório o certificado fitossanitário de origem para permissão de trânsito de cucurbitáceas nessa área.

A mosca das frutas, Ceratitis capitata, uma das primeiras pragas quarentenárias registradas no Brasil, é controlada pela técnica do inseto estéril, que consiste na criação, esterilização e liberação de insetos estéreis, principalmente machos, em número suficiente para exceder a população natural da praga.

Em sistema de plantio direto, o controle de plantas daninhas e consequente formação de cobertura do solo é realizado principalmente por herbicidas cujo princípio ativo é o glifosato, o 2,4D amina ou o paraquat. Os produtos comerciais à base desses princípios ativos devem ser pulverizados sobre as plantas daninhas e, devido à sua ação sistêmica, translocam-se pelo floema até as raízes, matando o mato em período aproximado de uma semana.

Quando do controle de plantas daninhas com o uso de herbicidas pós-emergentes, deve-se observar tanto as plantas daninhas como a cultura, visto que a idade delas afeta a absorção, a translocação e a atividade do herbicida. Plantas mais jovens são mais intolerantes aos herbicidas que as mais velhas, porque nelas predominam tecidos meristemáticos. Por isso, herbicidas que afetam processos metabólicos são muito tóxicos para plantas que possuem grande quantidade de tecidos meristemáticos e têm pouca ou nenhuma atividade em plantas mais velhas, nas quais predominam tecidos diferenciados.

As condições adequadas de pluviosidade e temperatura para o desenvolvimento da cana-de-açúcar estimulam a germinação e(ou) o desenvolvimento de plantas daninhas que disputam com a cultura espaço e fatores abióticos de produtividade. Nesse caso, é preciso conhecer o período crítico de convivência da cultura com a comunidade infestante: entre o 2.º e o 4.º mês após o plantio, para canade- açúcar de 18 meses; entre o 2.º e o 3.º mês após o plantio ou colheita, respectivamente, para cana-de-açúcar de 12 meses ou soqueira.

Antracnose e ramulose ocorrem com frequência na cotonicultura e são provocadas por fungos do gênero Colletotrichum. Transmitidos pelas sementes, provocam a diminuição da população de plantas devido ao tombamento pré e pós-emergência. Os sintomas desses patógenos nas sementes são semelhantes, todavia a discriminação é possível, pois, na antracnose, o fungo desenvolve-se rente ao tegumento e não forma micélio aéreo, enquanto, na ramulose, há formação de um micélio aéreo abundante e aspecto menos compacto. O agente causal da ramulose, ao se instalar no meristema apical, mata-o e favorece a brotação dos ramos laterais, provocando o superbrotamento.

Sementes tratadas são aquelas que sofreram a aplicação de agrotóxicos, corantes ou outros aditivos, que não gerou mudança significativa de tamanho, formato ou peso original.

A soja transgênica Roundup Ready possui um gene resistente ao herbicida paraquat, princípio ativo do produto comercial Roundup®, o que permite que o produtor aplique esse produto para controle das plantas daninhas sem prejudicar o desenvolvimento da lavoura.

Propor o código de ética das manipulações genéticas é atribuição da Comissão Técnica Nacional de Biossegurança (CTNBio), ligada ao Ministério da Ciência e Tecnologia.