Atualmente, o entendimento por parte de todos os protagonistas é de que a contratação de pessoal, bem como a compra de produtos e serviços para o SUS têm sofrido pouca influência direta do sistema de produção do conhecimento científico e tecnológico.

Há carência de um conselho de âmbito nacional para julgar projetos do ponto de vista ético, que envolvam o ser humano, sobretudo em relação às pesquisas em saúde.

A criação de uma agência de fomento à ciência e tecnologia especializada na área de saúde tem obtido significativa adesão da comunidade científica e profissional.

Em relação ao modelo de gestão de uma nova PNCTIS, a Comissão de Ciência e Tecnologia defendeu a idéia de manter no âmbito interno do MS o fomento às atividades de P&D.

A PNCTIS contemplou fracamente os principais condicionantes relativos à saúde coletiva.

As fundações de apoio à pesquisa de cinco estados (AM, PA, MA, MG e SP) firmaram o termo de compromisso para a criação da rede de pesquisa da malária.

Segundo declaração do ministro da Saúde, a Agência Nacional de Vigilância Sanitária tem sido eficiente, quanto à rapidez na tomada de decisões com respeito à atração de investimentos e redução da dependência tecnológica.

A proposta da PNCTIS desconsiderou a necessidade de redução das desigualdades e a construção de padrões éticos da pesquisa.

A PNCTIS considerou a necessidade de aumentar a capacidade indutora do sistema de fomento científico e tecnológico na área de saúde.

Entre as diretrizes da PNCTIS, destacam-se: a extensão, no que se refere à cadeia do conhecimento, e a inclusão, em relação aos pesquisadores, trabalhadores e usuários.