Na etapa denominada de inclusão, em que as amostras biológicas são preparadas para ser incluídas em parafina e, posteriormente, observadas em microscópio de luz, o conteúdo hídrico da amostra é substituído, geralmente, por etanol ou acetona.

O tamanho da amostra, o tempo de remoção da amostra de sua fonte e o tipo de fixador são fatores que devem ser considerados na preservação de amostras biológicas para microscopia.

A resina Lowicryl K4M, de natureza hidrofílica, é recomendada para o preparo de amostras biológicas destinadas à microscopia eletrônica de transmissão, sendo utilizada para imunodetecção, em virtude de ser permeável a anticorpos.

O preparo de amostras biológicas para microscopia eletrônica de transmissão realizado rotineiramente é feito em etapas sequenciais, que são, respectivamente, a fixação, a desidratação, a inclusão, a contrastação e a pós-fixação.

Tampões zwiteriônicos são compatíveis com a maioria dos meios de cultivo, sendo utilizados em sistemas em que é necessária a manutenção do pH fisiológico entre 6,15 e 8,35.

O uso de soluções fixadoras não tamponadas evita a ocorrência de modificações estruturais em amostras biológicas, sendo essencial à preservação das estruturas das proteínas, uma vez que impede a ocorrência de mudanças no pH da amostra.

A figura E apresenta uma capela de exaustão, que deve ser utilizada para manipulação de microrganismos patogênicos.

As pipetas, mostradas na figura C, são vidrarias empregadas na transferência e medição de volumes líquidos.

No preparo de soluções aquosas que partem de um soluto, é possível utilizar as vidrarias mostradas nas figuras B e G.