Em relação à exposição solar, deve-se colocar o comprimento dos canteiros voltado para a face norte, acompanhando-os ao longo de sua extensão. Contudo, tal medida para locação dos canteiros deve ser tomada apenas se for possível, pois existem outros critérios prioritários.

As mudas de espécies umbrófilas necessitam de luz solar na maior parte do seu ciclo de vida. Porém, antes de irem para o campo, exigem um sombreamento parcial para complementar o seu desenvolvimento.

Ao redor dos viveiros, podem ser plantadas espécies de árvores com função de formarem cortinas (quebra-vento) para proteger as mudas contra a ação dos ventos e fazer sombra nos canteiros de mudas para protegê-las contra os raios solares. Jamais se deve utilizar as mesmas espécies que estão sendo produzidas no viveiro.

O viveiro deve ser instalado em local ensolarado. Os raios solares contribuem para a rustificação dos tecidos, tornando as mudas mais robustas e resistentes. Se houver necessidade de sombra, pode-se lançar mão de abrigos, como o sombrite.

A declividade da área deverá ser de, no máximo, 2%, para evitar erosão. Um leve declive é recomendado para o escoamento da água. Os canteiros devem ser instalados em nível, perpendiculares à movimentação da água.

O viveiro deverá ser implantado em uma região rica em água. Os quantitativos de cálcio, sódio e boro nessa água deverão ser superiores a 400 ppm (partes por milhão).

O viveiro deverá ser localizado longe de cidades, de rodovias de fácil acesso e quando possível distante também das áreas de plantio. A proximidade de cidades e o fácil acesso podem contribuir para a deterioração das mudas no viveiro, em função da presença constante de pessoas estranhas. Por outro lado, a área de plantio distante evita a transmissão de doenças presentes no viveiro.

Para a Amazônia, o sistema agroflorestal é indicado, sobretudo, para as várzeas, onde os solos são pobres, e para as áreas de terras altas, onde os solos são férteis. Nas áreas de terras altas, deve-se priorizar as espécies agrícolas em detrimento das florestais.

A diversificação de espécies vegetais em um sistema agroflorestal contribui para inibir a propagação de insetos causadores de doenças. Em contrapartida, a maior umidade do ar que normalmente reina nessas áreas poderá favorecer o crescimento de fungos daninhos.

De forma geral, os sistemas agroflorestais têm inúmeras vantagens, mas, em contrapartida, também apresentam com freqüência uma desvantagem: a matéria orgânica retorna ao sistema em piores qualidades e menor quantidade.