O lúpus eritematoso sistêmico apresenta, nas lesões cutâneas, necrose fibrinoide na junção dermoepidérmica associada à atrofia epidérmica e degeneração liquefativa da camada basal.

No lúpus eritematoso discoide crônico, a deposição de imunoglobulinas e do complexo de ataque à membrana ocorre em 90% dos casos, mesmo em áreas de pele clinicamente não envolvidas.

A histologia do lúpus eritematoso discoide crônico é marcada por espessamento epidérmico, proliferação da camada basal e infiltração linfocítica perivascular superficial, poupando unidades pilossebáceas.

A infiltração linfocítica de Jessner é patognomônica e facilmente distinguível histologicamente do lúpus eritematoso discoide crônico.

A imunofluorescência direta é geralmente positiva nas lesões de erupção polimórfica à luz, evidenciando padrão em faixa ao longo da junção dermoepidérmica.