Após a fase aguda, caso a pessoa não receba tratamento oportuno, ela pode desenvolver a fase crônica da doença, inicialmente sem sintomas (forma indeterminada), podendo, com o passar dos anos, apresentar complicações.

O período de incubação da transmissão oral é de 2 a 3 meses.

A transmissão vertical ocorre com o contato com fezes de triatomíneos infectados após o repasto/alimentação sanguínea.

A transmissão vetorial ocorre pela passagem de parasitos de mulheres infectadas por T. cruzi para seus bebês durante a gravidez ou o parto.

O período de incubação da transmissão vetorial é de 30 a 40 dias ou mais.