O processo de higienização divide-se em duas etapas, pré-lavagem e desinfestação.

O Procedimento Operacional Prioritário (POP) deve ser escrito de forma objetiva, estabelecendo instruções sequenciais para a realização de operações rotineiras e específicas na produção, no armazenamento e no transporte de alimentos.

No manual de boas práticas de fabricação, as informações quanto ao controle da higiene e saúde dos manipuladores de alimentos são irrelevantes.

No sistema de controle integrado de pragas, as ações corretivas destinadas a impedir a atração, o abrigo, o acesso e (ou) proliferação de vetores e pragas urbanas, são desnecessárias.

A etapa de limpeza pode ser definida como operação de remoção de terra, resíduos de alimentos, sujidades e (ou) outras substâncias indesejáveis.