As unidades de conservação do grupo de proteção integral podem ser transformadas total ou parcialmente em unidades de uso sustentável, por instrumento normativo do mesmo nível hierárquico que criou a unidade, desde que obedecidos os procedimentos de consulta estabelecidos em lei.

O Sistema Estadual de Unidades de Conservação da Bahia possui, além das unidades de conservação de uso sustentável mencionadas na Lei n.º 9.985/2000, os parques urbanos, o horto florestal, o jardim botânico, o zoológico e o zoobotânico e a reserva particular de proteção da biodiversidade.

Um parque nacional, como o Parque Nacional de Brasília, o Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros, o Parque Nacional Marinho dos Abrolhos, o Parque Nacional Grande Sertão Veredas e o Parque Nacional da Chapada Diamantina, por poderem ser abertos à visitação pública e ao desenvolvimento de atividades vinculadas ao turismo, estão excluídos do conceito de unidade de conservação de proteção integral, vez que compatibilizam a conservação da natureza com o uso sustentável de parcela dos seus recursos naturais.

As unidades de conservação na Bahia, tanto as de proteção integral quanto as de uso sustentável, em razão da implementação da função socioambiental da propriedade, devem possuir uma zona de amortecimento e, quando conveniente, corredores ecológicos.