Os cistos foliculares se desenvolvem com maior frequência no primeiro ciclo pós-parto. Nesses casos, geralmente o cisto está associado ao anestro, não sendo acompanhado de ninfomania.

O cisto folicular, como um folículo ovariano imaturo, cresce, ovula, mas permanece no ovário produzindo hormônios que interferem no eixo hipotálamo-hipófise-ovário.

Há correlação negativa entre cisto folicular e outros distúrbios puerperais da vaca leiteira, tais como hipocalcemia pós-parto, distocia, retenção de placenta e cetose.

A etiopatogenia dos cistos foliculares é complexa, mas basicamente envolve exposição inadequada do folículo maduro pré-ovulatório à ação do FSH, resultando em ovulação precoce.

Quando o estímulo estrogênico é persistente, pode suceder fadiga do miométrio e, por conseguinte, acúmulo de secreção endometrial no lúmen uterino, resultando, eventualmente, no desenvolvimento de piometra.