No Brasil, não se recomenda o tratamento empírico rotineiramente devido ao índice crescente de resistência parasitária.

A toxicidade das drogas antiparasitárias é alta e, dessa forma, recomenda-se a realização do exame parasitológico de fezes e o tratamento com drogas de espectro restrito e específicas para o agente encontrado.

O albendazol, durante três dias, tem ação nas helmintíases e amebíase; durante cinco dias é eficaz também para o tratamento da giardíase.

A nitazoxanida na dose padrão tem polivalência antiparasitária e é eficaz inclusive no tratamento da criptosporidíase.

A ivermectina, quando usada empiricamente, deve ser administrada por cinco dias, atuando na ascaridíase, ancilostomíase, estrongiloidíase e giardíase.